学校的医学教育发轫于1965年湖北医学院咸宁分院，是办学历史最悠久、最具传统优势的学科领域之一。2021年8月，学校党委组建医学部，创新发展医学教育，下辖基础医学院、临床医学院、药学院、口腔与眼视光医学院、公共卫生与健康学院、生物医学工程与医学影像学院等6个教学院；设立医药研究院（糖尿病心脑血管病变湖北省重点实验室）、国家级全科医学实验教学示范中心、医用电子仪器设备湖北省工程研究中心、鄂南特色中药湖北省工程研究中心、细胞外囊泡转化应用湖北省工程研究中心、湖北省天然药物及仿生药物研究与开发企校联合创新中心、基础医学实验教学示范中心、药学与化学实验教学示范中心、医学教育研究所（医学教师发展中心）等9个教学科研公共平台。

现有职工405人，其中国家教学指导委员会委员1人，省级教学名师1人，“湖北名师工作室”主持人1人；正高职称59人，副高职称125人；具有博士学位的130人，硕士学位的215人；二级教授4人，三级教授4人；享受国务院津贴专家1人，享受省政府津贴专家5人，楚天学者和彩虹学者12人。

医学部现有本专科及硕士三个办学层次，普通、成教、来华留学三个办学类型，各类各层次在校医学生近万人，其中专科层次村医班为咸宁市“一村一名大学生村医”项目，卓越医师本科班为全国首批卓越医生教育培养计划项目，药学硕士专业学位点为国家特需项目。

医学部现有18个本科专业(临床医学、预防医学、公共事业管理、药学、临床药学、药物制剂、化妆品科学与技术、口腔医学、眼视光医学、眼视光学、护理学、助产学、医学影像学、生物医学工程、医学信息工程、医学影像技术、智能医学工程、健康服务与管理)，其中2个国家级一流专业建设点（药学、生物医学工程）、7个省级一流专业建设点（临床医学、临床药学、口腔医学、眼视光医学、护理学、医学影像学、预防医学）、国家“专业综合改革试点”项目1个（药学专业）、国家特色专业建设点2个（药学、生物医学工程）、省级“专业综合改革试点”2个（临床医学、生物医学工程）、“荆楚卓越人才”协同育人计划项目2个，有国家级一流课程1门,省级一流课程6门。临床医学专业通过教育部临床医学专业认证（有效期6年）。

现有医药相关专业实习医院：11所附属医院，9所教学医院，39所实习医院，5家社区卫生实践基地，3个国家住院医师规范化培训基地，5个湖北省住院医师规范化培训基地，形成了由附属医院、教学医院、实习医院、社区卫生实践基地共同构成的医学临床教学体系。

药学学科为湖北省“十二五”重点学科，“十三五”省属高校优势特色学科群主干学科，“十四五”湖北省优势特色学科群主干学科，是专业硕士研究生培养授权学科；临床医学是湖北省“十二五”重点（培育）学科,“十四五”湖北省优势特色学科群支撑学科；基础医学、公共卫生与预防医学、生物医学工程为“十四五”湖北省优势特色学科群支撑学科。

医学部现有省级重点实验室1个（糖尿病心脑血管病变湖北省重点实验室），省级工程研究中心3个（医学电子仪器技术湖北省工程研究中心、鄂南特色中药湖北省工程研究中心和细胞外囊泡转化应用湖北省工程研究中心），省级企校联合创新中心1个（湖北省天然药物及仿生药物研究与开发企校联合创新中心），市级产学研平台9个（咸宁市大健康产业研究院、咸宁市生物医药产业工程技术研究中心、咸宁市医疗器械校企共建研发中心、咸宁市药物制剂工程技术中心、咸宁市健康环境工程技术研究中心、咸宁市天然药物及仿生药物研究与开发企校联合创新中心、生态地道中药材开发利用关键技术研究企校联合创新中心、咸宁市现代医疗护理材料企校联合创新中心、咸宁市“崇六味”中药材综合利用企校联合创新中心）。